高通量皮升級液滴單細胞分選系統(tǒng)是基于液滴微流控技術(shù)開發(fā)而成的超高通量單細胞分選平臺。它每秒可以發(fā)生成千上萬的微液滴(pL),細胞包裹于微液滴之中,可進行生長、裂解、代謝、反應(yīng)等生物生化過程,并與液滴之中的熒光篩子進行充分結(jié)合,產(chǎn)生不同強度的熒光信號;之后利用微液滴分選技術(shù)將低產(chǎn)出和高產(chǎn)出的細胞通過熒光信號分選出來,實現(xiàn)分選過程的高通量化。
應(yīng)用案例:
案例一:合成D-阿洛酮糖3-差向異構(gòu)酶定向進化
構(gòu)建了基于液滴微流控(DREM cell)的超高通量篩選平臺,并與D-阿洛酮糖生物傳感器相結(jié)合,用于酮糖3-差向異構(gòu)酶(KEases)的定向進化;獲得突變體M3-2的催化效率比原始sfDAE提高17倍。
案例二:高產(chǎn)谷氨酰胺突變株高通量篩選
利用高通量皮升級液滴微流控細胞分選儀(DREM cell),對常壓室溫等離子體(ARTP)誘變的解淀粉芽孢桿菌全基因組突變庫進行超高通量篩選,成功獲得了一株谷氨酰胺酶產(chǎn)量提高47%以上的突變株。
案例三:谷氨棒桿菌高效分泌蛋白關(guān)聯(lián)基因挖掘
在谷棒中繪制了蛋白分泌的基因型-表型關(guān)聯(lián)圖譜,系統(tǒng)地揭示了其基因組中能夠用于改善分泌蛋白生產(chǎn)的基因位點,通過氧還轉(zhuǎn)錄因子CosR和RshA的組合敲除獲得VHH產(chǎn)量提高2.78倍的底盤菌株。
案例四:單細胞培養(yǎng)的蜜蜂腸道微生物功能多樣性研究
該研究利用高通量液滴微流控平臺(DREM cell),對蜜蜂腸道單個細菌進行皮升級液滴培養(yǎng)和niao槍法宏基因組測序,通過宏基因組分析展示了蜜蜂腸道微生物的菌株水平多樣性,揭示了不同細菌屬中潛在新菌株的存在。